Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms