Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms