Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SAMD8Q96LT4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SAMD8Q96LT4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SAMD8Q96LT4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SAMD8Q96LT4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SAMD8Q96LT4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SAMD8Q96LT4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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