Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms