Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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