Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3DQ96BQ1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms