Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms