Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms