Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD12Q8N8I0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms