Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD13CQ8N6S4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms