Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF10Q8N5U6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms