Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms