Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms