Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACAD11Q709F0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms