Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms