Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD1Q6UXZ0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms