Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms