Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms