Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SLC35B1-214ENST00000509781 806 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 30.2
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PRPF8Q6P2Q9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 30.1
PRPF8Q6P2Q9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 30.1
PRPF8Q6P2Q9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 30.1
PRPF8Q6P2Q9 PRELID1-204ENST00000503853 608 ntTSL 27.79□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 30.1
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PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-213ENST00000482192 793 ntTSL 39.99□□□□□ -0.815e-11■■■■■ 30.1
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1320.1 ms