Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms