Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms