Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms