Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PXDC1Q5TGL8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms