Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms