Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms