Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms