Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms