Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSF3Q4G176 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSF3Q4G176 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms