Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms