Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms