Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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