Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms