Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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