Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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