Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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