Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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