Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms