Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC3Q14574 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms