Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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BECN1Q14457 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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