Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms