Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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