Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms