Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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