Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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