Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms