Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms