Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms