Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms