Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms