Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms